1939年后，日军对抗日联军实行严酷的经济封锁，以70万兵力，对我南、东、北满抗日联军进行“大讨伐”，抗联开始进入一个极端艰苦的时期。据二军六师八团老战士乔邦义讲，六师八团每日行军100余华里，有时每天和敌人打24仗之多，即便如此，六师继续转战安图、和龙、抚松、濛江、金川、临江、长白一带，1939年活动于长白二十四道沟一带，1941攻打临江六道沟之后，于1942年转入东宁一带活动，后来几经周折去了苏联双城子南营。二军四师与一军二师辗转金川、桦甸、濛江、敦化一带，1941年3月，一路军副总指挥魏拯民逝世后，一、二军大部分指战员相继去苏联南营。1942年2月初，抗日联军第一、二、三方面军指战员大都去苏联，总人数达1600余名。

　　在苏期间，在周保中，冯仲云、李兆麟等军事领导干部主持下，制定了战斗和工作方案：一、冬天在苏冬训，夏季回国打游击；二、邀请苏方派教官对我官兵进行军事训练；三、自力更生开荒种地，解决部队生活困难；四、要求苏方援助把在苏所有抗日联军送延安进行抗日。不久，周保中接到斯大林的回信说，不必去延安，将来配合苏联红军打回东北作用更大。

　　1942年7月中旬，经斯大林批准建立远东方面军第八十八独立步兵旅，总人数达1600余名。7月28日，苏远东红军总部发布委任令；八十八旅团长周保中、副旅长兼政委李兆麟。旅团下设四个步兵营和两个属连。

　　1942年9月12日，八十八旅团召开了全体党员大会，通过选举产生了中共八十八旅团委员会，具体名称：独立步兵旅团中共东北党组织特别支部。旅团党委成员11人，其中在苏的7人，在东北打游击的4人。1945年归国前，旅团特别支部又分为松花江、黑龙江、佳木斯、延边、吉林、沈阳等地区委员会。

　　1945年7月，旅团委员会制定了反攻东北的作战计划：

　　（一） 组织100名先头部队，携带无线电空投东北进行侦察；

　　（二） 确定向导带领苏联红军打回东北；

　　（三） 抗日联军和苏联红军联合参战。

　　1945年7月末，八十八旅团委员会，又把原来成员分为东北工作团和朝鲜工作团，成立二个旅团委员会。

　　1945年8月，八十八旅团全体抗联指战员，配合苏联红军打回东北。